MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 plasmid pNGTCDC08107

Total Repeats: 695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017510	A	8	8	10	17	100 %	0 %	0 %	0 %	385334850
2	NC_017510	ATC	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334850
3	NC_017510	GCG	2	6	191	196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334850
4	NC_017510	ATC	2	6	207	212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334850
5	NC_017510	GCGG	2	8	227	234	0 %	0 %	75 %	25 %	385334850
6	NC_017510	GACG	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	385334850
7	NC_017510	GAGCA	2	10	269	278	40 %	0 %	40 %	20 %	385334850
8	NC_017510	TGT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334850
9	NC_017510	A	7	7	381	387	100 %	0 %	0 %	0 %	385334850
10	NC_017510	GAA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334850
11	NC_017510	GGCG	2	8	479	486	0 %	0 %	75 %	25 %	385334850
12	NC_017510	A	7	7	494	500	100 %	0 %	0 %	0 %	385334850
13	NC_017510	GGA	2	6	508	513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
14	NC_017510	GGAT	2	8	539	546	25 %	25 %	50 %	0 %	385334850
15	NC_017510	GA	3	6	550	555	50 %	0 %	50 %	0 %	385334850
16	NC_017510	CAT	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334850
17	NC_017510	A	6	6	723	728	100 %	0 %	0 %	0 %	385334850
18	NC_017510	AGG	2	6	837	842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
19	NC_017510	GGC	2	6	864	869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334850
20	NC_017510	T	6	6	874	879	0 %	100 %	0 %	0 %	385334850
21	NC_017510	CGC	2	6	941	946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
22	NC_017510	AGC	2	6	962	967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334850
23	NC_017510	CCG	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
24	NC_017510	T	8	8	1065	1072	0 %	100 %	0 %	0 %	385334850
25	NC_017510	TGC	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334850
26	NC_017510	AGG	2	6	1157	1162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
27	NC_017510	AAAG	2	8	1202	1209	75 %	0 %	25 %	0 %	385334850
28	NC_017510	TTAT	2	8	1260	1267	25 %	75 %	0 %	0 %	385334850
29	NC_017510	CGG	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334850
30	NC_017510	GCC	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
31	NC_017510	CGAT	2	8	1531	1538	25 %	25 %	25 %	25 %	385334850
32	NC_017510	GGGC	2	8	1571	1578	0 %	0 %	75 %	25 %	385334850
33	NC_017510	GCA	2	6	1582	1587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334850
34	NC_017510	GAG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
35	NC_017510	AGG	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
36	NC_017510	AGC	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334850
37	NC_017510	AGG	2	6	1903	1908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334850
38	NC_017510	GCAG	2	8	1930	1937	25 %	0 %	50 %	25 %	385334850
39	NC_017510	A	7	7	1963	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	385334850
40	NC_017510	CCG	2	6	1970	1975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334850
41	NC_017510	GTA	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334850
42	NC_017510	GA	3	6	2084	2089	50 %	0 %	50 %	0 %	385334850
43	NC_017510	TCAT	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	385334850
44	NC_017510	AT	3	6	2119	2124	50 %	50 %	0 %	0 %	385334850
45	NC_017510	A	6	6	2150	2155	100 %	0 %	0 %	0 %	385334850
46	NC_017510	AT	3	6	2160	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	385334850
47	NC_017510	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334850
48	NC_017510	GGCA	2	8	2235	2242	25 %	0 %	50 %	25 %	385334850
49	NC_017510	AGTGA	2	10	2336	2345	40 %	20 %	40 %	0 %	385334850
50	NC_017510	GCA	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
51	NC_017510	CAA	2	6	2435	2440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334851
52	NC_017510	CCAAGC	2	12	2459	2470	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385334851
53	NC_017510	CA	3	6	2540	2545	50 %	0 %	0 %	50 %	385334851
54	NC_017510	ACGG	2	8	2644	2651	25 %	0 %	50 %	25 %	385334851
55	NC_017510	AGC	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
56	NC_017510	CAT	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334851
57	NC_017510	TGG	2	6	2692	2697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334851
58	NC_017510	GAA	2	6	2741	2746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334851
59	NC_017510	GGC	2	6	2810	2815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334851
60	NC_017510	CTG	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334851
61	NC_017510	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	385334851
62	NC_017510	GGGTTT	2	12	2954	2965	0 %	50 %	50 %	0 %	385334851
63	NC_017510	GAA	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334851
64	NC_017510	CAA	2	6	3068	3073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334851
65	NC_017510	GAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334851
66	NC_017510	TCT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334851
67	NC_017510	AGG	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334851
68	NC_017510	CGC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334851
69	NC_017510	TGA	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334851
70	NC_017510	ACG	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
71	NC_017510	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334851
72	NC_017510	CGG	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334851
73	NC_017510	CGA	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334851
74	NC_017510	GTATGC	2	12	4081	4092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385334851
75	NC_017510	CAGG	2	8	4128	4135	25 %	0 %	50 %	25 %	385334851
76	NC_017510	GGC	2	6	4177	4182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334851
77	NC_017510	GC	3	6	4215	4220	0 %	0 %	50 %	50 %	385334851
78	NC_017510	ACCG	2	8	4245	4252	25 %	0 %	25 %	50 %	385334851
79	NC_017510	CCG	2	6	4341	4346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334852
80	NC_017510	TACAT	2	10	4463	4472	40 %	40 %	0 %	20 %	385334852
81	NC_017510	AAG	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334852
82	NC_017510	ATT	2	6	4548	4553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334852
83	NC_017510	TGA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334852
84	NC_017510	TTG	2	6	4569	4574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334852
85	NC_017510	GTT	2	6	4615	4620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334852
86	NC_017510	ACGG	2	8	4626	4633	25 %	0 %	50 %	25 %	385334852
87	NC_017510	GGC	2	6	4640	4645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334852
88	NC_017510	CG	3	6	4762	4767	0 %	0 %	50 %	50 %	385334852
89	NC_017510	TTA	2	6	4768	4773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334852
90	NC_017510	GA	3	6	4786	4791	50 %	0 %	50 %	0 %	385334852
91	NC_017510	GCC	2	6	4885	4890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334853
92	NC_017510	ACA	2	6	4946	4951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334853
93	NC_017510	TGCT	2	8	4973	4980	0 %	50 %	25 %	25 %	385334853
94	NC_017510	A	6	6	5062	5067	100 %	0 %	0 %	0 %	385334853
95	NC_017510	A	6	6	5080	5085	100 %	0 %	0 %	0 %	385334853
96	NC_017510	GTT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334853
97	NC_017510	AG	3	6	5255	5260	50 %	0 %	50 %	0 %	385334853
98	NC_017510	AGA	2	6	5274	5279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334853
99	NC_017510	CGG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334853
100	NC_017510	ACA	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334853
101	NC_017510	GTG	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334853
102	NC_017510	ATT	2	6	5486	5491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334853
103	NC_017510	TGGATG	2	12	5510	5521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385334853
104	NC_017510	AGC	2	6	5622	5627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
105	NC_017510	CCG	2	6	5683	5688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334853
106	NC_017510	TACC	2	8	5799	5806	25 %	25 %	0 %	50 %	385334853
107	NC_017510	GAT	2	6	5845	5850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334853
108	NC_017510	ATT	2	6	5974	5979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334853
109	NC_017510	GAC	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
110	NC_017510	CTG	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
111	NC_017510	A	6	6	6121	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	385334853
112	NC_017510	GCA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
113	NC_017510	CAG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
114	NC_017510	AAACC	2	10	6296	6305	60 %	0 %	0 %	40 %	385334853
115	NC_017510	CTG	2	6	6388	6393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
116	NC_017510	AAGG	2	8	6412	6419	50 %	0 %	50 %	0 %	385334853
117	NC_017510	CGG	2	6	6426	6431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334853
118	NC_017510	CTG	2	6	6472	6477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
119	NC_017510	CTG	2	6	6490	6495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
120	NC_017510	AGC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
121	NC_017510	AAG	2	6	6715	6720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334853
122	NC_017510	T	7	7	6775	6781	0 %	100 %	0 %	0 %	385334853
123	NC_017510	A	6	6	6856	6861	100 %	0 %	0 %	0 %	385334853
124	NC_017510	CGT	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334853
125	NC_017510	GCA	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334853
126	NC_017510	A	6	6	7230	7235	100 %	0 %	0 %	0 %	385334854
127	NC_017510	CGG	3	9	7313	7321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334854
128	NC_017510	GCC	2	6	7357	7362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334854
129	NC_017510	CAT	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334854
130	NC_017510	GA	3	6	7468	7473	50 %	0 %	50 %	0 %	385334854
131	NC_017510	TGT	2	6	7481	7486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334854
132	NC_017510	GGT	2	6	7610	7615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334854
133	NC_017510	GCC	2	6	7643	7648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334854
134	NC_017510	ACC	2	6	7726	7731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334854
135	NC_017510	TAT	2	6	7815	7820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334854
136	NC_017510	GGA	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334854
137	NC_017510	TTCA	2	8	7970	7977	25 %	50 %	0 %	25 %	385334854
138	NC_017510	TGCG	2	8	8047	8054	0 %	25 %	50 %	25 %	385334854
139	NC_017510	A	6	6	8068	8073	100 %	0 %	0 %	0 %	385334854
140	NC_017510	CAG	2	6	8118	8123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334854
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142	NC_017510	TGA	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334854
143	NC_017510	GAA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
144	NC_017510	ATG	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334854
145	NC_017510	GGC	2	6	8222	8227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334854
146	NC_017510	ATC	2	6	8229	8234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334854
147	NC_017510	GATG	2	8	8297	8304	25 %	25 %	50 %	0 %	385334854
148	NC_017510	GAA	2	6	8436	8441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
149	NC_017510	AGG	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334854
150	NC_017510	TCCC	2	8	8590	8597	0 %	25 %	0 %	75 %	385334854
151	NC_017510	TCAA	2	8	8602	8609	50 %	25 %	0 %	25 %	385334854
152	NC_017510	CCA	2	6	8638	8643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334854
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155	NC_017510	CTC	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385334854
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157	NC_017510	AGA	2	6	8927	8932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
158	NC_017510	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
159	NC_017510	GAA	2	6	8982	8987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
160	NC_017510	AGA	2	6	8990	8995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334854
161	NC_017510	CAA	2	6	9029	9034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334854
162	NC_017510	GT	3	6	9167	9172	0 %	50 %	50 %	0 %	385334854
163	NC_017510	GGAC	2	8	9197	9204	25 %	0 %	50 %	25 %	385334854
164	NC_017510	A	6	6	9234	9239	100 %	0 %	0 %	0 %	385334854
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169	NC_017510	A	6	6	9417	9422	100 %	0 %	0 %	0 %	385334854
170	NC_017510	GCT	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334854
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259	NC_017510	A	6	6	14677	14682	100 %	0 %	0 %	0 %	385334862
260	NC_017510	AAG	2	6	14686	14691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334862
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262	NC_017510	AGA	2	6	14765	14770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334862
263	NC_017510	A	6	6	14778	14783	100 %	0 %	0 %	0 %	385334862
264	NC_017510	CATT	2	8	14800	14807	25 %	50 %	0 %	25 %	385334862
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